Uf, actualizar a MacOS Sequoia y enfrentar este tipo de problema es un fastidio. Odio cuando mis herramientas dejan de funcionar. De todos modos, ¿has probado la aplicación Commander One? Es uno de esos clientes SFTP confiables que debería funcionar bien en MacOS Sequoia. La he usado para transferencias de archivos diarias y es bastante fácil de usar.
Échale un vistazo aquí: Commander One.
Fácil de entender, pero lo suficientemente potente para manejar todas tus necesidades. Una apuesta bastante segura, en mi opinión.